| 0. | 10.07.1999 | S.C. Ortmann 1921 (A) | 3:8 | - | - | - | |
| 0. | 17.07.1999 | Haladás FC 1995 (N) | 1:5 | - | - | - | |
| 10. | 30.10.1999 | Tennis Borussia Berlin (A) | 1:3 | - | x | - | |
| 0. | 12.11.1999 | WKP Lech Poznań (H) | 2:0 | - | - | - | |
| 0. | 16.11.1999 | FSV Hoyerswerda (H) | 3:1 | 1 | - | - | |
| 13. | 26.11.1999 | TSV Alemannia Aachen (H) | 4:1 | - | - | - | |
| 4. | 30.11.1999 | SC Freiburg (A) | 2:0 | - | - | x | |
| 14. | 04.12.1999 | SV Waldhof Mannheim 07 (A) | 2:1 | - | - | x | |
| 16. | 15.12.1999 | Offenbacher FC Kickers 1901 (H) | 5:0 | - | - | - | |
| 17. | 18.12.1999 | 1. FC Köln (A) | 4:1 | - | - | x | |
| 0. | 12.01.2000 | SV Babelsberg 03 (H) | 2:2 | - | - | - | |
| 0. | 14.01.2000 | FC Sachsen Leipzig (H) | 1:0 | - | - | - | |
| 0. | 18.01.2000 | F.C. Hansa Rostock (A) | 0:1 | - | - | - | |
| 0. | 23.01.2000 | FK Metallurg Saporoschje (N) | 0:0 | - | - | - | |
| 0. | 28.01.2000 | FK Zenit St. Petersburg (A) | 1:3 | - | x | - | |
| 0. | 06.02.2000 | KP Legia Warszawa (H) | 3:1 | - | x | - | |
| 18. | 13.02.2000 | S.C. Fortuna Köln (A) | 2:0 | - | - | x | |
| 19. | 21.02.2000 | SC Rot-Weiß Oberhausen 1904 (H) | 0:1 | - | x | - | |
| 20. | 26.02.2000 | 1. FSV Mainz 05 (A) | 1:0 | - | - | - | |
| 21. | 03.03.2000 | SpVgg Greuther Fürth (H) | 4:2 | - | - | - | |
| 24. | 27.03.2000 | Chemnitzer FC (A) | 1:2 | - | - | - | |
| 25. | 03.04.2000 | VfL Bochum 1848 (H) | 1:1 | - | - | - | |
| 27. | 15.04.2000 | Tennis Borussia Berlin (H) | 2:0 | - | - | - | |
| 28. | 23.04.2000 | Karlsruher SC (A) | 1:0 | - | - | - | |
| 30. | 05.05.2000 | TSV Alemannia Aachen (A) | 1:0 | - | - | - | |
| 31. | 14.05.2000 | SV Waldhof Mannheim 07 (H) | 3:2 | - | - | - | |
| 32. | 18.05.2000 | FC St. Pauli 1910 (H) | 3:2 | - | - | - | |
| 34. | 26.05.2000 | 1. FC Köln (H) | 2:0 | - | - | x | |
