| 1981/82 | Testspiel | BSG Energie Cottbus Jugend | 0:1 | 1. FC Union Berlin Jugend |
| 1984/85 | FDJ-Pokal der Jugend | 1. FC Union Berlin Jugend | 6:2 | BSG Energie Cottbus Jugend |
| 1985/86 | DDR-Jugendliga Staffel A | BSG Energie Cottbus Jugend | 1:4 | 1. FC Union Berlin Jugend |
| 1985/86 | DDR-Jugendliga Staffel A | 1. FC Union Berlin Jugend | 1:2 | BSG Energie Cottbus Jugend |
| 1986/87 | DDR-Jugendliga Staffel A | BSG Energie Cottbus Jugend | 2:3 | 1. FC Union Berlin Jugend |
| 1986/87 | DDR-Jugendliga Staffel A | 1. FC Union Berlin Jugend | 5:2 | BSG Energie Cottbus Jugend |
| 1987/88 | DDR-Jugendliga Staffel A | 1. FC Union Berlin Jugend | 1:3 | BSG Energie Cottbus Jugend |
| 1987/88 | DDR-Jugendliga Staffel A | BSG Energie Cottbus Jugend | 0:0 | 1. FC Union Berlin Jugend |
| 1988/89 | DDR-Jugendliga Staffel A | 1. FC Union Berlin Jugend | 2:3 | BSG Energie Cottbus Jugend |
| 1988/89 | DDR-Jugendliga Staffel A | BSG Energie Cottbus Jugend | 1:0 | 1. FC Union Berlin Jugend |
| 1989/90 | DDR-Jugendliga Staffel A | BSG Energie Cottbus Jugend | 0:3 | 1. FC Union Berlin Jugend |
| 1989/90 | DDR-Jugendliga Staffel A | 1. FC Union Berlin Jugend | 4:3 | BSG Energie Cottbus Jugend |
| 2003/04 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 1:3 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2003/04 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | FC Energie Cottbus B-Junioren | 1:0 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2003/04 | NOFV-Pokal der B-Junioren | FC Energie Cottbus B-Junioren | 4:0 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2004/05 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | FC Energie Cottbus B-Junioren | 3:2 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2004/05 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 0:1 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2005/06 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 1:3 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2005/06 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | FC Energie Cottbus B-Junioren | 2:1 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2006/07 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 0:0 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2006/07 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | FC Energie Cottbus B-Junioren | 4:2 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2009/10 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | FC Energie Cottbus B-Junioren | 1:4 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2009/10 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 1:2 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2010/11 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 2:0 U 0:2 | FC Energie Cottbus 2. B-Junioren |
| 2010/11 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | FC Energie Cottbus 2. B-Junioren | 2:0 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2011/12 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | FC Energie Cottbus 2. B-Junioren | 2:1 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2011/12 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 3:2 | FC Energie Cottbus 2. B-Junioren |
| 2012/13 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 6:0 | FC Energie Cottbus 2. B-Junioren |
| 2012/13 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | FC Energie Cottbus 2. B-Junioren | 1:4 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2013/14 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 0:2 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2013/14 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | FC Energie Cottbus B-Junioren | 2:2 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2014/15 | Testspiel | FC Energie Cottbus B-Junioren | -:- | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2014/15 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 2:0 | FC Energie Cottbus 2. B-Junioren |
| 2014/15 | B-Junioren-Regionalliga Nordost | FC Energie Cottbus 2. B-Junioren | 1:3 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2015/16 | NOFV-Pokal der B-Junioren | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 0:3 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2017/18 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 1:0 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2017/18 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | FC Energie Cottbus B-Junioren | 6:1 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2018/19 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | FC Energie Cottbus B-Junioren | 1:4 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2018/19 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 1:2 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2019/20 | Testspiel | FC Energie Cottbus B-Junioren | 0:5 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2019/20 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 1:3 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2019/20 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | FC Energie Cottbus B-Junioren | 3:3 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2020/21 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | - | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2020/21 | Testspiel | FC Energie Cottbus B-Junioren | 2:2 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2021/22 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 3:1 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2023/24 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 0:2 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
| 2023/24 | B-Junioren-Bundesliga Nord/Nordost | FC Energie Cottbus B-Junioren | 0:2 | 1. FC Union Berlin B-Junioren |
| 2024/25 | Testspiel | 1. FC Union Berlin B-Junioren | 6:3 | FC Energie Cottbus B-Junioren |
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Erläuterung:
Erst als '1. FC Union Berlin Jugend', ab 01.07.1991 als '1. FC Union Berlin B-Junioren' |
