| 0. | 10.01.2009 | TSV Alemannia Aachen (N) | 2:2 | - | x | - | |
| 0. | 14.01.2009 | AS Omonia Lefkosía 1948 B (N) | 1:10 | 1 | - | - | |
| 0. | 16.01.2009 | 1. FC Kaiserslautern (N) | 2:1 | - | - | x | |
| 0. | 21.01.2009 | FC Energie Cottbus II (H) | 4:0 | - | - | - | |
| 0. | 23.01.2009 | Chemnitzer FC (H) | 4:0 | 1 | - | x | |
| 3. | 28.01.2009 | Bayer 04 Leverkusen (A) | 3:1 | - | - | - | |
| 18. | 31.01.2009 | TSG 1899 Hoffenheim (A) | 2:0 | - | - | - | |
| 19. | 08.02.2009 | Hannover 96 (H) | 3:1 | - | x | - | |
| 20. | 15.02.2009 | BV Borussia 09 Dortmund (A) | 1:1 | - | x | - | |
| 21. | 21.02.2009 | SV Werder Bremen (H) | 2:1 | - | x | - | |
| 22. | 28.02.2009 | VfL Bochum 1848 (A) | 3:2 | - | x | - | |
| 23. | 07.03.2009 | Hertha BSC (H) | 1:3 | - | x | - | |
| 0. | 10.03.2009 | Zagłębie Lubin (H) | 3:1 | - | - | x | |
| 24. | 15.03.2009 | Hamburger SV (A) | 2:0 | - | - | - | |
| 25. | 21.03.2009 | 1. FC Köln (H) | 0:2 | - | x | - | |
| 0. | 27.03.2009 | SK Kladno (H) | 0:3 | - | - | x | |
| 26. | 04.04.2009 | Eintracht Frankfurt (A) | 2:1 | - | x | - | |
| 28. | 17.04.2009 | FC Schalke 04 (A) | 4:0 | - | x | - | |
| 0. | 22.04.2009 | FC Stahl Brandenburg (A) | 0:3 | - | - | x | |
